Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms