Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms