Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SUMO1P63165 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SUMO1P63165 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SUMO1P63165 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SUMO1P63165 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms