Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms