Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK-21P61565 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-21P61565 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms