Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCBP3P57721 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms