Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLE2P56282 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms