Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GFRA1P56159 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GFRA1P56159 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GFRA1P56159 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GFRA1P56159 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GFRA1P56159 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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