Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms