Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms