Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms