Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM4P49221 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM4P49221 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM4P49221 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms