Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms