Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms