Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSBP45954 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms