Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT2P45379 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms