Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms