Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms