Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms