Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms