Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6P35125 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6P35125 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6P35125 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6P35125 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms