Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CASQ1P31415 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASQ1P31415 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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