Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms