Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA6P31267 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA6P31267 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms