Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CRABP1P29762 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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