Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms