Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms