Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
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