Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms