Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHP20396 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHP20396 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHP20396 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRHP20396 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRHP20396 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRHP20396 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHP20396 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms