Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms