Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFTRP13569 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFTRP13569 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFTRP13569 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFTRP13569 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms