Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms