Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRCP08575 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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