Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPBP07988 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms