Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TYMSP04818 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TYMSP04818 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TYMSP04818 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TYMSP04818 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TYMSP04818 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TYMSP04818 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TYMSP04818 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms