Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KDM4BO94953 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms