Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NBNO60934 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBNO60934 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBNO60934 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBNO60934 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms