Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GMDSO60547 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms