Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALUO43852 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALUO43852 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALUO43852 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms