Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCAO15360 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms