Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CEP290O15078 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP290O15078 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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CEP290O15078 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CEP290O15078 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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CEP290O15078 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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CEP290O15078 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP290O15078 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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