Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms