Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms