Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DXG7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DXG7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DXG7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DXG7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms