Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC169A6NNP5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms