Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms