Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms