Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP20Q9Y6A4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms