Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMACHCQ9Y4U1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMACHCQ9Y4U1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMACHCQ9Y4U1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms